Niveau concerné: Seconde

Partie du programme concernée: Universalité et variabilité de la molécule d'ADN

Objectif de connaissances:

L'ADN est formé de deux chaînes complémentaires de nucléotides (A, T, C, G).

Objectif méthodologiques:

Utiliser des modèle 3D de molécules.
Communiquer par un schéma.

Fichiers pdb nécessaires: adn.pdb - ( nucade.pdb - nucthy.pdb - nuccyt.pdb - nucgua.pdb)
  

Question: L'ADN est le support universel de l'information génétique. Comment est constitué l'ADN ?
 

Quelle forme géométrique a la molécule d'ADN ? De combien de chaînes est formée la molécule d'ADN ?	- ouvrir Molusc et choisir "Analyse d'une molécule".  - ouvrir le fichier adn.pdb - choisir "Afficher" puis "Sphères" - choisir "Colorer" puis "Chaînes"
La molécule d'ADN a une forme d'hélice / spirale double.  Elle est formée de 2 chaînes.

Les éléments constituant l'ADN sont appelés nucléotides. Comment sont disposés les nucléotides sur chaque chaîne ? Comment sont disposés les nucléotides d'une chaîne par rapport à ceux de l'autre chaîne ?	- choisir "Afficher" puis "Bâtonnets"  - choisir "Colorer" puis "Résidus" puis "ATCGU"
Les nucléotides sont disposés les uns après les autres sur chacune des chaînes.  Les nucléotides sont disposés les uns en face des autres et sont associés 2 par 2.

Quelles sont les règles d'association des nucléotides entre les 2 chaînes?	- choisir "Afficher" puis "Etiquettes" puis "Résidus"
En face de T (nucléotide à Thymine) il y a toujours A (nucléotide à Adénine). En face de C (nucléotide à Cytosine) il y a toujours G (nucléotide à Guanine)

Si l'on désire détailler la structure des nucléotides ---> fichiers nucade.pdb / nucthy.pdb / nucgua.pdb / nuccyt.pdb
 

Exemple d'image obtenue à la deuxième étape :

Synthèse:

Construire une portion de la molécule d'ADN comprenant 8 nucléotides
(on fournit 4 modèles simplifiés de nucléotides à utiliser pour la construction du schéma)

---> Modèle comprenant 2 chaînes de nucléotides (nucléotides liés les uns aux autres à l'intérieur de chaque chaîne) complémentaires 2 à 2 (complémentarité entre les nucléotides qui se font face).

Rédiger en une phrase un bilan concernant la structure de la molécule d'ADN.

---> La molécule d'ADN est constituée de 2 chaînes complémentaires de nucléotides ce qui lui donne une forme de double hélice.
 
Comment ouvrir un fichier pdb:

Les fichiers pdb nécessaires doivent avoir été téléchargés auparavant (voir introduction) puis placés dans un dossier.

Pour les ouvrir cliquer sur "Parcourir" (Browse en anglais) puis dans la boîte de dialogue qui s'affiche choisir dans le menu déroulant "Type" l'option "tous les fichiers" (All files en anglais) - Cliquer sur le fichier choisi puis sur "ouvrir".

De nouveau cliquer sur "ouvrir" dans la fenêtre de Molusc. La représentation 3D de la molécule s'affiche alors.