Activités

Utilisation de Molusc

Visionneuse pour l'analyse et la comparaison de Molécules à Usage Scolaire

MolUSc est un programme qui permet de visualiser des molécules en 3D, de les analyser, les comparer, les colorer.... Il nécessite:

- un Navigateur: Netscape Communicator version 4 ou Internet Explorer versions 5 et ultérieures.
- le plugin Chime (petit programme qui permettra à votre navigateur d'afficher les molécules en 3D)
- des fichiers de molécules en 3D (fichiers avec l'extension .pdb)
 
Où télécharger MolUSc ?

Sur le site académique d'Orléans-Tours:http://www.ac-orleans-tours.fr/svt/mol3d/molusc/pcindex.htm

Où télécharger Chime ?

Sur le site de l'INRP: http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/visu3d.htm

Où trouver des fichiers pdb ?

Ceux nécessaires aux séquences proposées sont téléchargeables sur ce serveur.

Sur le site de l'académie d'Orléans-Tours (belle présentation des molécules disponibles en téléchargement)
http://www.ac-orleans-tours.fr/svt/mol3d/librairie/pcindex.htm

Sur le site de Protéin Data Bank: http://www.rcsb.org/pdb/

Sur le site de l'académie d'Aix Marseille: http://pedagogie.ac-aix-marseille.fr/geniebio/bioch/3dmol/3dmol.htm

Moleculars Models from Chemistry at Okanagan University College: http://www.okanagan.bc.ca/chem/molecule/molecule.html

Library of 3-D Molecular Structures de l'Université de New York: http://www.nyu.edu/pages/mathmol/library/

Molecular Viewing Gallery: http://www.dcu.ie/~chemist/pratt/pdb/gallery.htm
 

Grâce au plugin Chime que Molusc utilise on peut véritablement explorer la molécule en 3D et cela par un simple mouvement de la souris:

- bouton droit enfoncé  +  mouvements horizontaux et verticaux : on fait pivoter la molécule selon les axes X et Y
- touche majuscule et bouton droit enfoncé  +  mouvements horizontaux : on fait pivoter la molécule selon l'axe Z.
- touche majuscule et bouton gauche enfoncé  +  mouvements verticaux : Zoom.

Précautions à prendre:

- Ne pas utiliser de caractères accentués dans le nom des fichiers ou des répertoires dans lesquels vous téléchargerez les fichiers pdb sinon MolUSc ne pourra les ouvrir.

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